يهدف فرع التشريح إلى تحقيق رسالته من خلال تطبيق رؤياه الخاصة بتعليم التشريح البشري الحديث من خلال:
1.ربط التعليم في فرع التشريح بالاحتياجات الصحية الأساسية بحيث يكون الطبيب في المستقبل قادراً على تحديد ومواجهة المشاكل الصحية للمجتمع من خلال المنهج التكاملي الحديث والذي يكون محوره الطالب بشكل اساسي حيث يتم مناقشة مفردات المنهج نظريا وعمليا وبشكل تفاعلي بين الاستاذ والطلبة ويتم فيها عقد حلقات نقاشية لمجاميع صغيرة من الطلبة و سمنارات وامتحانات نظريه وعملية وبأشراف اعضاء الكادر التدريسي لتنمية روح الفريق الواحد على ان يكون الطالب :
قادرا على فهم المصطلحات التشريحية واستعمالها بصورة صحيحة-
-معرفة التشريح السطحي والداخلي لجسم الإنسان
- معرفة التركيب الدقيق لأجهزة وأنسجة الجسم المختلفة
اكتساب الطالب خبرة ومعلومات معمقة في الجانب التطبيقي والسريري والشعاعي للتشريح .-
-معرفة عملية تكوين الإنسان بصورة طبيعية والعيوب الخلقية الممكن حدوثها
2. تحسين الفاعلية التعليمية وذلك عن طريق التطوير المستمر للبرامج والخطط الدراسية مع الأخذ بكل ما هو جديد
3. تنمية قدرات أعضاء هيئة التدريس لمواكبة التطور المستمر في التعليم الطبي وتطوير الموارد التعليمية والاستخدام الأمثل له.
4. تطوير بيئة البحث العلمي والتعاون مع المؤسسات المحلية والإقليمية والعالمية في مجال البحوث الطبية لتشجيع أعضاء هيئة التدريس لأجراء البحوث الطبية المتعلقة بالاختصاص ونشرها بالمجلات العلمية والمؤتمرات المعنية