تقوم وحدة الحسابات بالمهام التالية:               

1. مراجعة جميع المعاملات الواردة من العمادة والفروع والإدارات الأخرى (مشتريات ، سلف ، أمانات ، رواتب ، جميع المصروفات ، إلخ قبل إرسالها للتدقيق).
2. متابعة أبواب الميزانية وتقديم الاعتماد الجاري قبل الشراء.
3. إعداد الميزانية التقديرية للكلية.
4. تحرير أدوات المعاملات المنجزة والمدققة.
5. متابعة الجداول التي ترسل شهريا لرئاسة الجامعة.
6- متابعة التمويل من رئاسة الجامعة والتدفق النقدي مع البنك.